1.სააგენტოს სახელმწიფო კონტროლს ახორციელებს სამინისტრო, რომელსაც უფლება აქვს , მოითხოვოს ამისთვის საჭირო მასალები და ინფორმაცია.
2.სამინისტრო უფლებამოსილია შეამოწმოს სააგენტოს საფინანსო-ეკონომიკური საქმიანობა , ასევე მის მიერ განხორციელებული საქმიანობის კანონიერება და მიზანშეწონილობა.
3.